Конечно же, дополнения не самая важная часть работы, но они должны быть. Во-первых, необходимо вынести все дополнения, которые у вас имеются в электронном виде в отдельный файл. Нумерацию страниц в этом файле проставлять нельзя. Каждое отдельное дополнение должно начинаться с новой страницы (пользуйтесь разрывом страницы – Ctrl+Enter). Все рисунки и таблицы подписываются буквами или цифрами согласно методичке. Важный момент – все дополнения в работе должны следовать в том же порядке, в котором они упоминаются в самой работе в виде ссылок. Чем больше в дипломе дополнений, тем лучше, но без фанатизма.
Кстати, будете смеяться, но в той магистерской, которую я писал для себя, было от силы десять страниц дополнений :). Соответственно, сама работа в распечатанном виде была, наверное, самой тоненькой на три выпускные группы! Я и сейчас вспоминаю глаза работницы, которая принимала мое творение на прошивку :). Но мне это не помешало отлично защититься. Ведь самое главное при написании диплома полностью раскрыть тему и выполнить поставленные во введении цель и задания дипломной работы.